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23 mars 2021

par eLife

La domestication a un effet constant sur le microbiote intestinal des animaux et est similaire aux effets de l’industrialisation dans les populations humaines, avec des différences écologiques telles que le régime alimentaire ayant une forte influence

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Ces résultats, publiés aujourd’hui dans eLife, mettent en évidence comment la flexibilité du microbiote intestinal peut aider les animaux à réagir au changement écologique et pourrait aider à identifier des moyens de manipuler les communautés microbiennes intestinales au service de la santé.

Les animaux ont généralement des communautés complexes de microbes vivant dans leur intestin qui peuvent fortement influencer des fonctions telles que l’immunité et le métabolisme Ces communautés peuvent être extrêmement diverses et différer considérablement entre les espèces et même les individus Nous savons, par exemple, que les animaux domestiques, comme les souris de laboratoire, ont des communautés microbiennes intestinales différentes de celles de leurs parents sauvages. On a même vu de grands changements dans le microbiote intestinal des populations humaines industrialisées, dont certains ont été liés à la montée de certaines maladies

Au cours de la domestication, les animaux ont subi de profonds changements écologiques qui ont probablement façonné leur microbiote intestinal «Les animaux domestiques et les populations humaines industrialisées ont potentiellement connu des changements écologiques similaires, tels que des régimes alimentaires moins diversifiés et plus faciles à digérer, des densités de population plus élevées et des interventions médicales plus nombreuses», explique le premier auteur Aspen Reese, qui était boursier postdoctoral junior de la Society of Fellows, Harvard University, États-Unis, au moment où l’étude a été réalisée, et est maintenant professeur adjoint à l’Université de Californie, San Diego, États-Unis. « Nous voulions savoir si la domestication avait des effets cohérents sur le microbiote intestinal des animaux et si les effets étaient effectivement similaires à ceux de l’industrialisation chez l’homme. »

Pour évaluer les effets de la domestication, l’équipe a séquencé et comparé l’ADN microbien extrait d’échantillons fécaux de 18 espèces de mammifères sauvages et domestiqués. Ils ont constaté que la domestication avait un effet global clair sur le microbiote intestinal, bien que les différences spécifiques dépendaient de l’espèce.

La domestication implique une forte pression de sélection sur les animaux, entraînant d’importants changements génétiques et physiologiques qui peuvent également affecter les communautés microbiennes intestinales Pour décortiquer les rôles relatifs de l’écologie et de la génétique, l’équipe a ensuite échangé les régimes des animaux sauvages et domestiques. Ils ont constaté que les communautés microbiennes intestinales d’animaux apparentés, tels que les loups et les chiens, se ressemblaient beaucoup plus, soutenant l’idée que les régimes alimentaires modifiés expliquent au moins certains des changements dans le microbiote intestinal observés avec la domestication.

Pour comprendre si de telles différences se produisent également chez les humains, ils ont ensuite comparé les communautés microbiennes intestinales des humains à celles des chimpanzés, l’un de nos plus proches parents vivants, et entre les humains vivant dans des populations industrialisées et non industrialisées. Ils ont constaté que les différences entre le microbiote intestinal des humains et des chimpanzés étaient similaires à celles observées entre les animaux domestiques et sauvages, les changements les plus importants étant évidents dans les populations industrialisées. Parce que tous les humains sont également liés aux chimpanzés, ces résultats ont montré que les facteurs écologiques plutôt que la génétique sont à l’origine des aspects du microbiote intestinal partagé entre les animaux domestiques et les humains vivant dans des populations industrialisées.

« Nos recherches montrent que la flexibilité du microbiote intestinal aide probablement les animaux et les humains à réagir à un changement écologique rapide », conclut Rachel Carmody, professeure adjointe au Département de biologie évolutive humaine de l’Université Harvard. « Mais, en même temps, cette flexibilité peut créer des opportunités de décalage entre le microbiote intestinal dont nous disposons et celui auquel notre corps a évolué. Alors que nous apprécions de plus en plus le rôle central du microbiote intestinal en biologie, comprendre les facteurs qui le façonnent chez les animaux et les humains peut nous aider à identifier de nouvelles façons d’améliorer les modèles animaux expérimentaux, le bien-être des animaux dont nous dépendons et, finalement, la santé humaine. »

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Microbiote intestinal, microbiome humain, tractus gastro-intestinal, domestication des animaux, écologie

Actualités – États-Unis – La domestication et l’industrialisation entraînent des changements similaires dans le microbiote intestinal
Titre associé :
La domestication et l’industrialisation conduisent à des changements similaires microbiote intestinal

Source: https://phys.org/news/2021-03-domestication-industrialisation-similar-gut-microbiota.html

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