Les scientifiques de l’EPFL et de l’UNIL ont utilisé une nouvelle approche algorithmique sur les cellules cancéreuses pour acquérir des connaissances et comment les changements dans les marqueurs d’histones (H3K27ac) et induire le repositionnement des régions de la chromatine dans le noyau cellulaire Les scientifiques ont également décrit comment les modifications des contacts locaux entre les éléments régulateurs appelés amplificateurs et promoteurs influencent l’expression des oncogènes. La recherche tente d’acquérir une nouvelle compréhension du cancer et des méthodes potentielles pour le combattre

Le cancer est une maladie extrêmement complexe qui est en partie ce qui rend la recherche sur le cancer si difficile Pour mieux comprendre le cancer, les chercheurs concentrent leur attention sur le génome S’ils peuvent comprendre ce qui se passe au niveau de l’ADN, les scientifiques espèrent qu’il sera possible de traiter et de prévenir complètement les cancers à l’avenir. Les chercheurs de ce projet ont fait une découverte révolutionnaire concernant une aberration génétique critique qui se produit dans le cancer

L’équipe a utilisé une nouvelle méthode basée sur un algorithme pour étudier comment les cellules cancéreuses réorganisent la structure 3D de l’ADN pour intensifier l’activité de gènes favorisant le cancer appelés oncogènes Les scientifiques se sont concentrés sur quatre chromosomes où l’ADN est emballé à l’intérieur de la cellule et comment les chromosomes sont organisés à l’intérieur des petits confins du noyau cellulaire. Dans l’ADN normal, chaque cellule porte 23 chromosomes et deux copies pour chaque chromosome Cependant, la structure et l’organisation des chromosomes changent dans les cellules cancéreuses

Les scientifiques disent qu’un morceau d’une copie du chromosome 8 peut être attaché à une copie du chromosome 14 dans une cellule cancéreuse Les chromosomes peuvent également prendre une structure plus détendue ou compacte en fonction des modifications chimiques appelées marques épigénétiques Les scientifiques de ce projet ont étudié comment les changements dans des marques épigénétiques spécifiques modifient les structures chromosomiques et l’expression de gènes favorisant la croissance tumorale connus sous le nom d’oncogènes.

L’approche de l’algorithme génétique utilisée par l’équipe s’appelle Calder et permet de suivre comment les régions génomiques sont positionnées les unes par rapport aux autres à l’intérieur du noyau L’équipe a utilisé l’approche pour comparer l’organisation spatiale du génome dans plus de 100 échantillons Calder a suivi les régions de chromatine qui «se sont déplacées» d’une zone du noyau à une autre en raison de l’évolution des marques épigénétiques Les équipes ont découvert que dans les cellules de lymphome, des changements épigénétiques spécifiques entraînent le repositionnement des régions de la chromatine dans différentes zones du noyau, ce qui entraîne de nouvelles interactions locales qui suractivent l’expression des oncogènes.

Cellule cancéreuse, cellule

Actualités – États-Unis – Les chercheurs utilisent une approche algorithmique pour comprendre comment le cancer modifie les marqueurs d’histones
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Comment les cellules cancéreuses réorganisent la structure 3D de leur ADN ?

Source: https://www.slashgear.com/researchers-use-an-algorithmic-approach-to-understand-how-cancer-changes-histone-markers-11672267/

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