Certains des gènes du génome humain semblent conférer un effet protecteur contre la maladie grave à coronavirus 2019 (COVID-19), causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) Un nouvel article publié en ligne dans la revue PNAS décrit les gènes impliqués dans l’immunité innée qui ont subi des variations entre différents sous-groupes humains

La prévalence des maladies infectieuses varie en fonction des conditions environnementales, qui varient considérablement selon les régions du monde Ceux-ci agissent comme des facteurs sélectifs sur les variantes génétiques, telles que les variantes génétiques du récepteur de type péage qui réduisent la sensibilité à certaines infections bactériennes et allergies.

Encore une fois, les protéines des cellules hôtes qui interagissent avec les virus à ARN sont codées dans diverses régions de l’ADN humain, et en tant que telles, ces virus pourraient avoir stimulé de nombreux changements de ce type.

Une étude antérieure a montré une association entre un haplotype sur le chromosome 3 et le risque de maladie critique au COVID-19 Le risque d’admission en unité de soins intensifs (USI) après le SRAS-CoV-2 a été doublé avec chaque copie de cette variante

Ce gène est présent chez 65% des porteurs en Asie du Sud, mais 16% en Europe, mais remarquablement, il est absent en Asie de l’Est Les chercheurs émettent l’hypothèse que cela est dû à un effet bénéfique de l’haplotype en Asie du Sud contre d’autres agents pathogènes antérieurs, mais a maintenant été sélectionné négativement en Asie de l’Est

L’étude actuelle, du consortium Genetic of Mortality in Critical Care (GenOMICC), a examiné plus de 2200 patients et témoins critiques du COVID-19 Cette étude a montré une région à risque sur le chromosome 3, avec sept loci qui affectent l’ensemble du génome, situés sur les chromosomes 6, 12, 19 et 21

Les mutations aux locus des chromosomes 6, 19 et 21 sont des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) qui augmentent le risque d’admissions aux soins intensifs chez les patients COVID-19 et correspondent aux allèles trouvés dans l’ADN humain supposé être d’origine néandertalienne Pourtant, ceux-ci ne se trouvent pas dans les génomes de plus d’une centaine de Yoruba africains disponibles sur le projet 1000 Genomes

Les chercheurs ont comparé cela aux données de la COVID-19 Host Genetics Initiative (HGI) Cela a montré que les SNP sur le chromosome 12 qui étaient liés à l’hospitalisation chez les patients COVID-19 étaient en déséquilibre de liaison chez les Européens. Cet haplotype de 75 kb a été comparé aux génomes actuels et plus anciens

L’étude a utilisé des haplotypes trouvés dix fois ou plus parmi les individus du projet 1000 Genomes et parmi les génomes de squelettes de Néandertal et de Denisovan de grottes de Sibérie et de Croatie En utilisant des techniques phylogénétiques, ils ont découvert que huit des 64 haplotypes humains modernes étaient étroitement liés aux trois squelettes plus anciens.

Les chercheurs ont ensuite effectué un calcul destiné à distinguer un segment du génome qui provenait d’un ancêtre commun des humains modernes et des Néandertaliens, de celui qui a été incorporé dans le génome humain moderne des Néandertaliens par mélange des groupes Ils ont constaté qu’un segment de 75 ko n’aurait probablement pas survécu aussi longtemps s’il était descendu d’un ancêtre commun

L’étude a également révélé que la variante d’index de l’haplotype protecteur était similaire à celle trouvée dans les trois génomes de Néandertal et réduisait le risque d’admission aux soins intensifs de plus d’un cinquième avec chaque copie. Les génomes de Néandertal contenaient 34 des 35 SNP qui co-agrégent avec le variant de SNP protecteur

Cet haplotype se trouve dans 25% à 30% de la plupart des populations eurasiennes mais il est presque nul en Afrique subsaharienne Il est présent, bien qu’à des niveaux inférieurs, dans certaines populations ethniquement liées à l’Afrique Cela pourrait être dû à des flux de gènes provenant de populations européennes ou amérindiennes, dans ce cas

L’haplotype protecteur contient des parties de trois gènes, appelés OAS1, OAS2 et OAS3, qui codent pour des enzymes induites par des interférons et activées par des ARN double brin L’effet de ces enzymes, appelées oligoadénylate synthétases, est de produire des chaînes oligoadényliques qui déclenchent la ribonucléase L, décomposant l’ARN double brin dans la cellule, un mécanisme antiviral classique dans les cellules infectées. D’autres voies antivirales sont également activées par la ribonucléase L

Certains allèles de Néandertal semblent être fonctionnellement importants, comme un SNP qui affecte un site d’affecteur d’épissage dans OAS1 Cela s’est avéré auparavant protecteur contre le virus du Nil occidental Le remplacement de l’allèle ancestral présent dans l’haplotype de Néandertal par d’autres variantes conduit à des isoformes moins protectrices de cette protéine

Cet allèle ancestral n’est actuellement présent que dans ce contexte en dehors de l’Afrique Fait intéressant, chez les Africains d’aujourd’hui, l’allèle ancestral se trouve uniquement en tant que variante génétique indépendante de l’haplotype de Néandertal

L’haplotype de Néandertal semble également conférer plus de résistance à l’hépatite C Encore une fois, la variante faux-sens OAS1 est protectrice contre le SRAS-CoV, selon une petite étude

En utilisant des milliers de génomes provenant de fossiles humains antérieurs, les chercheurs affirment que la fréquence de l’haplotype néandertalien OAS a augmenté de 10% à 30% au fil des siècles, la dernière augmentation des populations eurasiennes semblant s’être produite assez récemment

Une étude plus approfondie sera nécessaire, en utilisant des données provenant de fossiles trouvés autres que l’Eurasie occidentale et en traçant les fréquences alléliques au fil du temps, ainsi qu’en ajustant les migrations de grands groupes de population qui tiennent compte des changements dans les fréquences alléliques sur des génomes entiers

L’haplotype de Neandertal chromosome 12 est donc protecteur contre le COVID-19 sévère et se trouve à des fréquences de 50% ou plus en Eurasie et dans les Amériques L’activité enzymatique accrue des variantes ancestrales a peut-être été bénéfique pour les populations ultérieures qui l’ont acquise par mélange génétique, car elles ont été exposées à de nouveaux virus à ARN.

Il est intéressant de noter que le locus OAS dérivé de Néandertal a récemment augmenté en fréquence en Eurasiesuggérant que ce locus a été sélectionné positivement”

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Dr Liji Thomas est OB-GYN, diplômé du Government Medical College, Université de Calicut, Kerala, en 2001 Liji a exercé en tant que consultante à temps plein en obstétrique / gynécologie dans un hôpital privé pendant quelques années après avoir obtenu son diplôme Elle a conseillé des centaines de patientes confrontées à des problèmes liés à la grossesse et à l’infertilité, et a été en charge de plus de 2000 accouchements, s’efforçant toujours d’obtenir un accouchement normal plutôt que chirurgical.

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Thomas, Liji (2021, 22 février) Le gène néandertalien peut conférer une protection contre le COVID-19 sévère, selon une étude Actualités-Médical Extrait le 23 février 2021 de https: // wwwnouvelles-médicalnet / news / 20210222 / Le gène de Néandertal peut conférer une protection contre une étude-de-découverte-sévère-COVID-19aspx

Thomas, Liji “Le gène de Neandertal peut conférer une protection contre le COVID-19 sévère, selon une étude” Actualités-Médical 23 février 2021

Thomas, Liji “Le gène de Neandertal peut conférer une protection contre le COVID-19 sévère, selon une étude” Actualités-Médical https: // wwwnouvelles-médicalnet / news / 20210222 / Le gène de Néandertal peut conférer une protection contre une étude-de-découverte-sévère-COVID-19aspx (consulté le 23 février 2021)

Thomas, Liji 2021 Le gène néandertalien peut conférer une protection contre le COVID-19 sévère, selon une étude News-Medical, consulté le 23 février 2021, https: // wwwnouvelles-médicalnet / news / 20210222 / Le gène de Néandertal peut conférer une protection contre une étude-de-découverte-sévère-COVID-19aspx

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Actualités – GB – Le gène néandertalien peut conférer une protection contre le COVID-19 sévère, selon une étude
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Le gène néandertalien peut conférer une protection contre COVID-19 sévère, trouve une étude

Source: https://www.news-medical.net/news/20210222/Neanderthal-gene-can-confer-protection-against-severe-COVID-19-finds-study.aspx

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