L’Islande a classé génétiquement tous les cas positifs de Covid-19 depuis le début de l’épidémie, une pratique de plus en plus vitale alors que de nouvelles souches troublantes émergent de Grande-Bretagne et d’Afrique du Sud

L’Organisation mondiale de la santé a exhorté vendredi tous les pays à accélérer le séquençage du génome pour aider à lutter contre les variantes émergentes.

Les scientifiques du laboratoire de génétique deCODE du groupe islandais de médicaments biologiques à Reykjavik ont ​​travaillé sans relâche ces 10 derniers mois, analysant chaque test positif pour le coronavirus en Islande à la demande des autorités sanitaires du pays

L’objectif est de suivre chaque cas afin d’éviter que des cas problématiques ne se faufilent sur le réseau

“Le séquençage proprement dit prend relativement peu de temps”, explique le responsable du laboratoire, Olafur Thor Magnuson, ajoutant qu ‘”environ trois heures” suffisent pour déterminer la souche du virus

L’ensemble du processus, de l’isolement de l’ADN au séquençage, peut prendre jusqu’à un jour et demi, et l’Islande a identifié 463 espèces différentes – ce que les scientifiques appellent des haplotypes

Avant le séquençage, l’ADN de chaque échantillon est d’abord isolé, puis purifié avec des billes magnétiques

Les échantillons sont ensuite transportés dans une salle immense et lumineuse remplie d’équipements, où un son assourdissant est émis par de minuscules machines ressemblant à des scanners.

À l’intérieur de chaque machine, il y a une boîte noire appelée “Flow Cell”, qui est une lame de verre contenant des particules d’ADN

“La séquence d’échantillons est essentielle pour nous aider à suivre l’état de l’épidémie et son évolution”, a déclaré à l’AFP le ministre de la Santé Svandis Svvarsdottir.

Elle a déclaré que les autorités avaient utilisé les informations de séquence pour décider de mesures précises et ciblées pour limiter la propagation du virus.

Bien que la variante sud-africaine n’ait pas été détectée en Islande, 41 sujets ont été identifiés comme porteurs de la variante britannique

Ils sont tous arrêtés à la frontière – où des tests PCR sont effectués sur les voyageurs – bloquant efficacement la transmission de variantes sur l’île sub-polaire

L’identification ADN a également permis d’établir un lien clair entre les visiteurs d’un bar du centre de Reykjavik et la majorité des infections lors d’une nouvelle vague à la mi-septembre – incitant les autorités à fermer les bars et les boîtes de nuit de la capitale

La séquence a également identifié une souche distincte de touristes français qui avaient été testés positifs pour le virus à leur arrivée en Islande, qui ont été initialement accusés – à tort – d’être la cause de l’augmentation de septembre

Les 6000 cas de Covid-19 signalés en Islande ont été séquencés, ce qui en fait le leader mondial de la séquence Covid

Alors que de nombreux pays, tels que la Grande-Bretagne, le Danemark, l’Australie et la Nouvelle-Zélande, mettent en œuvre des niveaux élevés de séquençage, aucun ne se rapproche des niveaux de l’Islande, bien que les statistiques mondiales soient incomplètes

Fondée en 1996, la société a mené la plus grande étude génétique jamais réalisée sur la population

Pour une étude de 2015 sur les facteurs de risque de cancer, il a séquencé l’ensemble des génomes de 2500 Islandais et étudié le profil génétique d’un tiers de la population de 330 habitants.000

«Il est très facile de séquencer ce génome viral: il ne s’agit que de 30 000 nucléotides, rien», s’interroge Carrie Stefanson, fondatrice et PDG de 71 ans.

A titre de comparaison, le génome humain analysé normalement dans ses laboratoires se compose de 3 et ajoute 4 milliards de paires de nucléotides, ou molécules organiques.

Bien que la séquence stricte de l’Islande ait été utile pour suivre la propagation du virus, elle n’a pas encore abouti à des découvertes scientifiques majeures pour deCODE

“S’il existe des différences entre des virus avec des mutations de types différents, elles ne sont pas tout à fait claires”, déclare Stefanson, “Ce n’est pas assez clair pour nous de les recevoir.”

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Actualités – Californie – Championne de la cartographie génétique L’Islande ouvre la voie en matière de séquençage COVID-19
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L’Islande, championne de la cartographie génétique La méthode est dans l’ordre de Covid

Source: https://au.news.yahoo.com/gene-mapping-champion-iceland-leads-014942393.html

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