Les scientifiques peuvent désormais identifier des cellules individuelles à partir d’une population croissante à la surface d’une boîte de laboratoire et étudier leur contenu moléculaire. Le nouvel outil a été développé par des chercheurs de l’Institut de génie biomédical et du Donnelly Center, et permettra une étude plus approfondie des cellules souches et d’autres types de cellules rares. Traitement

Cette méthode est la première à combiner la microscopie cellulaire avec des plates-formes omiques pour corréler les paramètres physiques des cellules visibles à l’œil, comme l’apparence et la présence de marqueurs de surface ou de contacts cellule-cellule, avec leur structure moléculaire.

“Nous donnons à l’utilisateur la possibilité de prendre de superbes images de microscopie à fluorescence pour apprendre tout ce qui peut être appris sur les cellules se développant in situ, puis de corréler ces informations avec le génome cellulaire, le transcrit et les protéines”, explique le professeur Aaron Wheeler (chimie, BME, Donnelly Center), qui a dirigé Action

Nommée DISCO, pour l’isolement numérique de cellules individuelles microfluidiques pour la -omique, la méthode permet aux chercheurs de sélectionner des cellules individuelles dans leur environnement local et d’analyser leur contenu à l’aide de techniques de séquençage d’ADN et de protéines pour lire l’ADN de la cellule (génome), transcrire les gènes d’ARN ( Transcript) et particules de protéine (protéase)

La montée en puissance des analyses monocellulaires au cours des cinq dernières années a permis aux chercheurs de mesurer des dizaines de milliers de molécules dans chaque cellule, transformant leur capacité à étudier les tissus et les organes au niveau granulaire, mais ces méthodes manquent d’informations importantes sur les caractéristiques physiques des cellules et l’environnement local car les cellules doivent être placées dans Commentez et séparez-les les uns des autres avant l’analyse

Mais j’ai rencontré des gens qui sont déçus de ne pas être en mesure de capturer des informations phénotypiques sur la cellule dans son environnement in situ », explique Wheeler, chef de la recherche en analyse biologique microfluidique au Canada.

“Je pense que nous pourrons peut-être trouver un moyen de sélectionner et d’analyser des cellules spécifiques de ce groupe”, dit-il.

DISCO se compose d’un microscope équipé d’un laser haute fréquence et d’une puce microfluidique pour collecter le matériau cellulaire. Le microscope permet à l’utilisateur de prendre des images détaillées de la cellule cible avant que le laser ne lui soit appliqué. L’énergie du laser provoque la formation d’une petite bulle et apparaît près de la cellule, ce qui conduit à déchirer sa membrane et à libérer son contenu sur Déposer le formulaire sur une lame microfluidique, où il est récupéré pour le séquençage moléculaire

“Notre plateforme se concentre sur les métadonnées que vous perdez lorsque vous suspendez une seule cellule, des choses comme la position de la cellule, quelles sont ses caractéristiques morphologiques et qui sont ses voisins?”, déclare Erica Scott, stagiaire postdoctorale au laboratoire qui a dirigé le travail avec deux doctorants à Lab, Julian Lamana et Harrison Edwards, ce sont toutes les choses que nous pouvons capturer avant de faire le séquençage d’une seule cellule.

“Pour autant que nous le sachions, c’est la seule plate-forme qui peut mettre des cellules en culture et faire ce genre de chose”, dit-elle

Comme preuve d’expériences de base, les chercheurs ont démontré la capacité de DISCO à relier fidèlement les données omiques aux cellules cancéreuses du cerveau humain et de souris cultivées côte à côte

Mais les résultats soulignent également comment la communication intracellulaire affecte leurs états moléculaires.L’expression massive de 5000 gènes de souris – environ un cinquième des génomes – a été modifiée dans des cellules de souris individuelles entourées de cellules humaines plutôt que de leurs parents

Les résultats peuvent avoir des implications importantes pour de nombreux laboratoires qui cherchent à mieux comprendre les tissus humains sains et malades, tels que les tumeurs, en les implantant chez des souris afin qu’ils puissent être étudiés dans tout l’environnement corporel, a déclaré Wheeler: Si l’expression des gènes est affectée de la même manière par la vaccination humaine, Ces changements peuvent avoir des implications sur le développement du traitement.

Heureusement, DISCO pourrait bientôt offrir une fenêtre sur les cellules dans leur environnement naturel alors que les chercheurs s’efforcent de les adapter à l’analyse de coupes de tissus. Leur objectif ultime est d’appliquer DISCO à l’étude de types de cellules rares, comme les cellules souches, dont le potentiel de régénération est largement régulé par leur environnement. Direct, pour aider à développer de nouveaux traitements

Cette recherche a été financée par Génome Canada, par l’intermédiaire de Génomique de l’Ontario, du Prix Connaught pour l’innovation, de la Fondation canadienne pour l’innovation (FCI), du Fonds de recherche de l’Ontario (ORF), du Conseil des sciences naturelles et de la recherche en génie (CRSNG) et par le Medicine About The Design Pathway à l’Université de Toronto, qui reçoit un financement du Fonds canadien pour l’excellence en recherche (FCREF)

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Cellule, Recherche

Actualités – CA – Des chercheurs de l’U of T ont développé un nouvel outil pour collecter le contenu des cellules individuelles de l’environnement local – U of T Engineering News
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U de phase Les chercheurs T dispose d’un nouvel outil pour extraire le contenu des cellules individuelles de l’environnement local

Source: https://news.engineering.utoronto.ca/u-of-t-researchers-develop-new-tool-for-scooping-contents-of-individual-cells-from-local-environment/

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